El Archivo de Música Colonial Americana nació en el año 1998 con el fin de albergar el importante corpus documental personal donado por la Dra. Carmen García Muñoz (1929-1998) al IIMCV tras su muerte. Dicho material abarca principalmente reproducciones fotográficas de documentación musical manuscrita original de los siglos XVII, XVIII y XIX depositados en diferentes archivos musicales de Latinoamérica. Entre ellos se destacan: el repositorio musical del Semanario de San Antonio Abad de Cusco (Perú), el Archivo Arzobispal de Lima (Perú) y el Archivo de la Catedral de Sucre y Fondo Elena Fortún (Bolivia, actualmente unificados en la Biblioteca Nacional de Bolivia). Una gran parte de estas fotografías – tomadas por García Muñoz durante sus viajes de estudio en las décadas de 1960, 1970 y 1980 – se encontraba en soporte de negativos, siendo tarea de los miembros del IIMCV el revelado, ordenamiento, clasificación y catalogación del material completo el cual, actualmente, se encuentra en proceso de digitalización.